Pada 31 Januari 2006, Kaliammal memohon Mahkamah Rayuan untuk mengisytiharkan bahawa Mahkamah Tinggi telah salah dalam keputusannya sebelum ini yang membuat kesimpulan bahawa ia tidak mempunyai bidang kuasa untuk menentukan kesahihan penukaran kepada Islam. Dia berharap dapat melepaskan tubuh dan melakukan pembakaran mayat Hindu.[3] Mahkamah mengumumkan pada 20 Jun 2006 bahawa mereka akan membuat keputusan pada bulan September; Walau bagaimanapun, mereka menekankan bahawa keputusan mereka hanya berkaitan dengan perkara bidang kuasa Mahkamah Tinggi sivil, dan mereka tidak akan memerintah sama ada Moorthy adalah seorang Hindu yang mengamalkan semasa kematiannya.[14][15][16]

Persatuan Peguam Syarie mengkritik Majlis Agama Islam Wilayah Persekutuan untuk kes asal, menyatakan bahawa tidak wajar mereka memfailkan permohonan ex parte di Mahkamah Tinggi Syariah atas perkara itu.[1] Hari selepas pengkebumian, Pengerusi Wong Kim Kong, Setiausaha Agung Felo Kristian Evangelical Nasional (NECF), juga berkata, "Kami tidak sedap hati, kami tidak selesa, kami berasa terancam." Beliau menambah, "Kami bimbang Syariah mungkin suatu hari menjadi undang-undang tertinggi di bumi."[17] Anwar Ibrahim, bekas timbalan perdana menteri yang menamatkan hukuman penjara pada September 2004, menunjuk kepada kes Moorthy sebagai contoh bagaimana kerajaan "menghalang hak bukan Islam".[18] Satu kumpulan sokongan untuk agama minoriti berkata, keputusan itu "menunjukkan mahkamah Islam adalah tidak konsisten dalam perlindungan minoriti agama", membandingkan kes itu kepada yang Wong Ah Kiu, juga dikenali sebagai Nyonya binti Tahir, seorang wanita etnik Melayu dilahirkan sebagai seorang Islam tetapi dibesarkan dalam keluarga Buddha China, yang anak-anaknya mendapat kebenaran daripada mahkamah Negeri Sembilan untuk mengebumikannya sebagai seorang Buddha kurang dari sebulan selepas kes Moorthy.[3] Kes itu juga menarik perhatian di India, di mana Vishva Hindu Parishad memfailkan protes dengan Pesuruhjaya Tinggi Malaysia, mengutuk pengebumian sebagai pelanggaran hak asasi manusia.[19]